Στην επόμενη φάση του Fiba Basketball Champions League η ΑΕΚ κληρώθηκε με τις Νίζνι, Τουρκ Τέλεκομ και Στρασμπούργκ.
Για τους σκοπούς της κλήρωσης των Play-Offs, οι 16 ομάδες που είχαν προκριθεί χωρίστηκαν ανάλογα με τη θέση που κατέλαβαν στον όμιλό τους στην Κανονική Περίοδο. Οι ομάδες που τερμάτισαν στην 1η θέση ήταν στο 1ο γκρουπ, ενώ στο 2ο ήταν οι ομάδες που κατέλαβαν τη 2η θέση των ομίλων.
Γκρουπ 1: Μπάμπεργκ, Σαραγόσα, Χάποελ Χολόν, Μπούργος, Τενερίφη, Στρασμπούρ, Τόφας, Τουρκ Τέλεκομ
Γκρουπ 2: AEK, Σάσσαρι, Νίμπουρκ, Μπρίντιζι, Iγκοκέα, Νίζνι, Καρσίγιακα, Ρίγα
Οι 16 ομάδες τοποθετήθηκαν σε τέσσερις νέους ομίλους που απαρτίζονται από ισάριθμες ομάδες. Οι ομάδες θα τεθούν αντιμέτωπες μεταξύ τους εντός κι εκτός έδρας, με τις δύο πρώτες κάθε ομίλου να κερδίζουν εισιτήριο για το Final 8, με το οποίο θα ολοκληρωθεί η σεζόν 2020-21 την πρώτη εβδομάδα του Μαΐου.
Tα Play-Offs θα ξεκινήσουν το διήμερο 2-3 Μαρτίου και θα ολοκληρωθούν το διήμερο 6-7 Απριλίου. Το πλήρες, ανανεωμένο πρόγραμμα θα γίνει γνωστό μετά την κλήρωση για τα Play-Offs.
Η κλήρωση ξεκίνησε με τις ομάδες του 2ου γκρουπ. Οι οκτώ ομάδες που τερμάτισαν δεύτερες κληρώθηκαν πρώτες και στη συνέχεια ακολούθησαν οι ομάδες από το 1ο γκρουπ. Ο μόνος περιορισμός ήταν πως δεν μπορούν να κληρωθούν μεταξύ τους ομάδες που ήταν μαζί στον ίδιο όμιλο της Κανονικής Περιόδου ενώ μπορούν να κληρωθούν ομάδες από την ίδια χώρα.
H κληρωτίδα έφερε σαν αντιπάλους στην ΑΕΚ στον 11ο όμιλο τις Τουρκ Τέλεκομ (Τουρκία), Στρασμπούργκ (Γαλλία) και Νίζνι (Ρωσία).
ενώ οι υπόλοιποι όμιλοι διαμορφώθηκαν ως εξής:
9ος όμιλος
Χάποελ Χολόν (Ισραήλ)
Τόφας (Τουρκία)
Μπρίντιζι (Ιταλία)
Καρσίγιακα (Τουρκία)
10ος όμιλος
Τενερίφη (Ισπανία)
Μπούργος (Ισπανία)
Ρίγα (Λετονία)
Ιγκογκέα (Βοσνία-Ερζεγοβίνη)
12ος όμιλος
Μπάμπεργκ (Γερμανία)
Σαραγόσα (Ισπανία)
Νίμπουρκ (Τσεχία)
Σάσσαρι (Ιταλία)
Οι πρώτες δύο ομάδες κάθε ομίλου θα προκριθούν στο Final Eight (5-9 Μαΐου 2021), του οποίου η τοποθεσία διεξαγωγής θα ανακοινωθεί μετά το φινάλε των Play-Offs, στις αρχές Απριλίου και έπειτα μια ακόμη κλήρωση θα καθορίσει τα ζευγάρια του Final Eight.